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Molecular characterization and genetic relationships of cultivated Tunisian olive varieties (Olea europaea L.) using SSR markers

S. ABDELHAMID 1,*

A. OMRI 1

N. GRATI-KAMOUN 1

F. Paolo MARRA 2

T. CARUSO 2

 

1 Olive Institute, Molecular Biology Laboratory, Cité Taffala, 4061 Sousse, Tunisia

2 Department of Agricultural and Forest Sciences (SAF), University of Palermo, Viale delle Scienze 11, 90128-Palermo, Italy

 

Abstract - We studied 58 trees belonging to 13 Tunisian cultivated olive varieties (O. europaea L.) from 3 regions of origin (north, center and south) evaluated by means of simple sequence repeat (SSR) markers. In total, 7 simple sequence repeats (SSR) loci used in this study and revealed 51 alleles with a mean number of 7.29 alleles per locus and a mean polymorphic information content (PIC) of 0.693 showing a high genetic diversity of Tunisian olive cultivars. A larger variability than expected was found in the analyzed genotypes. Clustering of individual accessions based on UPGMA dendrogram separated accessions out to four major clusters. The analysis of molecular variance (AMOVA) indicated that genetic differentiation occurred mainly within populations. Bayesian model-based clustering method show inference of relationships between cultivars according to geographic criteria and allowed us to identify putative admixed cultivars.  Hence, the study revealed a homogenous genetic structure of Tunisian olive cultivars, probably due to the geographical origin of the genus olea. The information collected in this study can be used for olive breeding strategies and for the management and the conservation of Tunisian olive germplasm.

 

Keywords: Olea europaea L.; Genetic structure; Microsatellites; Genetic diversity; Olive

 

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Physico-chemical characterization and microbiological quality evaluation of klila, an artisanal hard dried cheese from Algerian’s arid areas: Preliminary study

Caracterisation physicochimique et qualite microbiologique du klila : un fromage traditionnel sec des regions arides d’Algerie : Etude preliminaire

 

A. MERIBAI 1

R. JENIDI 2

Y. HAMMOUCHE 1

A. BENSOLTANE 3

 

1 Laboratory of Characterization and Valorization of Natural Products (LCVNP), Faculty of Nature and Life Sciences, Earth and Universe (SNV-STU), University of El Bachir El-Ibrahimi, Bordj Bou Arreridj (34000), Algeria.

2 Faculty of Nature and Life Sciences, Earth and Universe (SNV-STU), University of El Bachir El-Ibrahimi, Bordj Bou Arreridj (34000), Algeria.

3 Laboratory of Food and Industrial Microbiology– Faculty of Biological Sciences- University of Oran. Algeria.

 

Abstract - Klila is an artisanal hard dried cheese, made from bovine, ovine or goat milk. This study aimed to evaluate physic-chemical and microbiological quality of twenty one Klila samples, including seven samples prepared from cow’s milk (V), seven from goat’s milk (Ch) and seven from sheep’s milk (Br), collected from various livestock farms in Bibans arid areas, in Bordj Bou-Arreridj region, North-eastern Algeria. Results Physicochemical tests gave average pH of 4,47, average acidity: 27,71°D, conductivity : 01,095 ms/cm, dry matter: 35,03% and ash : 0,34%. Microbiological analyzes average fecal flora (1,24× 103 CFU / g), fecal coliforms (0,84 CFU/g), indol- floras (0,32), fecal Streptococci (2,130 CFU/g). Conclusion: If sample’s hygiene levels were acceptable, exploration of lactic acid floras, protein and fat rates are desirable.

 

Keywords: Klila, Physico-chemicals Analysis, Bacteriological quality, Fecal flora, Streptococci.

 

Résumé - Klila est un fromage traditionnel dur, fabriqué à base de lait de vache, de brebis ou de chèvre. L’objectif de l’étude est d’évaluer les qualités physico-chimiques et microbiologiques d’un effectif de vingt et un échantillons de Klila dont sept sont préparés à base de lait de vache (V), sept de chèvre, (Ch) et sept de brebis (Br), collectés dans différentes fermes d’élevage de la région aride des Bibans, wilaya de Bordj Bou-Arreridj, Nord-Est algérien. Les tests physicochimiques ont donné des pH moyens de l’ordre de 4,47, une acidité moyenne de 27,71°D, une conductivité de 1,095 ms/cm, la matière sèche étant de 35,03% et le taux de cendres de 0,34%. Les analyses bactériologiques ont donné des charges moyennes en flore aérobie mésophile de 01,24 x103 UFC/g, les coliformes fécaux étant de 0,84UFC/g, les flores indologènes de 0,32 et les streptocoques fécaux de 2,13 UFC/g. Conclusion: Si les niveaux d’hygiène des échantillons se sont avérés acceptables, l’exploration des charges en flores lactiques et la détermination des taux de protéines et de matières grasses restent néanmoins sou haitables.

 

Mots clés: Klila, Analyses Physico-chimiques, Qualité microbiologique, Coliformes fécaux, Streptocoques.

 

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Identification and pathogenicity of Fungi associated with Decline of cork oak in the North West of Tunisia

F. HASNAOUI*1

I. ZOUAOUI1

W. OULED SEGHAEIR1

C. ABBES1

 

1 Institut Sylvo-Pastoral de Tabarka, Tunisia.

 

Abstract - Decline events have recently been observed in several cork oak (Quercus suber) forests in northwest Tunisia (Kroumirie). The affected trees show crown thinning, leaf yellowing, branch dieback, cankers, epicormic shoots and exudates on branches and trunk. Six species: Biscogniauxia mediterranea, Botryosphaeria corticola, Cytospora sp., Discula quercina, Fusicoccum sp. and Pleurophoma cava were constantly isolated from cankered and dieback branches of affected plants. Pathogenicity tests on 3-years-old cork oak seedlings confirmed the aggressiveness of all species. The obtained results emphasize the need to develop further research into the real incidence and distribution of these pathogens involved in the etiology of decline phenomena in the Tunisian cork oak forest.

 

Keywords: pathogens, decline, cork oak

 

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Influence of rootstock and viroids on the yield of half-blood Maltese and the gross margin generated

Influence du porte-greffe et des viroïdes sur le rendement de la maltaise demi- sanguine et sur la marge brute générée

 

A. NAJAR1

S. MLAOUHI2

A. JEMMALI1

 

1 Laboratory of Plant Protection L, National Institute of Agriculture Research of Tunisia. University of Carthage, Tunisia

2 Laboratory of Rural economics, National Institute of Agriculture Research of Tunisia. University of Carthage, Tunisia

 

Abstract - Tunisian citrus orchards are exclusively based on the use of the single rootstock, Sour orange, which is mainly threatened by Tristeza virus. Tristeza has killed more than 100 million orange trees worldwide, causing important economic consequences. The best protection method against the virus is to substitute the sensitive sour orange by rootstocks that should provide tolerant orange trees. Such measurement may allow a better production and ensure sustainable economic profit. Since, the Tunisian Maltese is considered the most important citrus fruit in Tunisia; a rootstock trial has been installed since 2005 at the Tunisian National Institute for Agronomic Research, to evaluate the production of Maltese grafted on seven healthy rootstocks and the economic impact of the two most important viroids: Citrus exocortis viroid or CEVd and Hop stunt viroid (HSVd) on the Maltese / rootstock combination for the inoculated trees. The results have showed that except for the Poncirus trifoliata, the Citrus volkameriana and Rangpur lime provided the highest cumulated yields compared to the Sour orange, followed by the Citrumelo swingle with 78, 74 and 63 T/ha, respectively. The Citrange carrizo comes in the 4th position with 51 T/ha. The mandarin Cleopatra and the sour orange gave similar yields evaluated at 44 T / ha. Thereby, the production of the healthy Maltese grafted on the different new rootstocks has generated a gross margin (GM) more important than that obtained by sour orange. The Citrus volkameriana and Rangpur lime were reported to be the most economically lucrative rootstock. Indeed, their generated GM are the highest (more than 10 million DT/ha), particularly in 2015. The increase is more than 200% compared to the sour orange GM. Under the viroids effect, the same decrease trend of yields and GM occurring is observed for all rootstock inoculated with CEVd and HSVd. Based on the finding, the sour orange may be substituted in the Maltese case by other tristeza tolerant rootstock, including Citrus volkameriana, lime rangpur, Citrange carrizo and Citrumelo swingle. This is possible when plants certified healthy against viroids, considered to be prohibited diseases by the certification legislation, were used.

 

Keywords: Viroïds, Exocortis, Cachexia, Rootstock, Yield, Economic impact

 

Résumé - L’agrumiculture tunisienne basée sur l’utilisation exclusive d’un seul porte-greffe qui est le bigaradier, se trouve de plus en plus menacée par le virus de la tristeza qui a causé le dépérissement de plus de 100 millions d’orangers dans le monde. Ces dégâts auraient certainement des conséquences économiques importantes. De ce fait, un travail de contribution à la lutte à moyen et à long termes a été entamé. Il consiste à remplacer le bigaradier très sensible par des porte-greffes qui devraient donner avec les orangers des plants tolérants au virus, permettant une meilleure production et assurant un profit économique.  Pour ce faire, un essai porte-greffe a été installé depuis 2005 à la station d'El Gobba de l’Institut National de Recherche Agronomique de Tunisie pour une étude visant l’évaluation de la production de la Maltaise greffée sur sept porte-greffes sains.et de l’effet des 2 viroïdes les plus importants: Citrus exocortis viroid (CEVd) et Hop stunt viroid (HSVd) sur la combinaison Maltaise/Porte-greffe dans le cas d'arbres inoculés.  Dans le cas de la Maltaise greffée sur porte greffes sains, les résultats ont montré qu'abstraction faite du Poncirus trifoliata, le Citrus volkameriana et la lime Rangpur confèrent les rendements cumulés les plus élevés suivi du Citrumelo swingle affichant respectivement 78, 74 et 63 T/ha. Le Citrange carrizo vient en quatrième position avec 51 T/ha. Le Mandarinier Cléopâtre et le bigaradier donnent des rendements très proches de 44 T/ha. Ainsi, le Citrus volkameriana et la lime Rangpur sont considérés comme étant les porte greffes les plus rentables économiquement avec les MB les plus élevées (plus de 10 Milles DT/ha) particulièrement en 2015, dépassant celle du bigaradier d’environ 200%. Sous l'effet des viroïdes la même tendance est relevée, bien qu'une certaine diminution des rendements et des MB soit observée pour tous les portes greffes inoculés par le CEVd et le HSVd.  Le bigaradier peut être donc substitué pour le cas de la maltaise par d'autres porte greffes tolérants à la tristeza à savoir: le Citrus volkameriana, la lime rangpur, le Citrange carrizo et le Citrumelo swingle, à condition de démarrer la multiplication à partir de plants certifiés sains.

 

Mots clés: Viroïdes, Exocortis, Cachexie, Porte greffe, Rendement, impact économique

 

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Antimicrobial Effects of Pistacia lentiscus L. Foliar Extracts on fresh turkey breast cutlets

Effets antimicrobiens des extraits foliaires de Pistacia lentiscus L. dans des escalopes de dinde

 

H. DEBBABI 1

K. NEMRI 1,2

H. RIAHI 3

 

1 Laboratory of AgroFood Industries, National Agronomic Institute of Tunisia, University of Carthage, Tunisia.

2 Institut Supérieur des Etudes Technologiques de Sidi Bouzid, Tunisia

3 Laboratory of Research and Development, Canned food industries Group, Tunis, Tunisia.

 

Abstract - Nowadays, the food industry is constantly seeking natural, safe and low-cost antimicrobial agents in an attempt to replace synthetic additives. The objective of this study was to evaluate Pistacia lentiscus L. foliar extracts as natural additives to fresh turkey cutlets. First, in vitro antimicrobial activity of the aqueous extracts prepared by maceration, infusion, decoction and digestion and essential oil obtained by hydrodistillation of Pistacia lentiscus leaves was studied by disc-diffusion method, against seven bacterial and three fungal strains.The infused and digested extracts inhibited Enterococcus faecalis and Staphylococcus aureus more than the essential oil and were inactive towards Escherichia coli and Salmonella enteritidis. They led to an inhibition of the growth of Penicillium (35%) and Fusarium (19%). In a second step, the application on fresh turkey breast cutlets of crushed dry leaves and infused aqueous extract led to inhibit the growth of the total aerobic mesophilic flora and the fungal flora during storage at + 4°C for 8 days. In conclusion, Pistacia lentiscus L. foliar extracts can be used to reduce microbial spoilage during storage of fresh turkey breast cutlets.

 

Keywords: food conservation, Pistacia lentiscus, plant extracts, mastic tree, total viable counts

 

Résumé - L'objectif de cette étude est d'évaluer les extraits de feuilles de Pistacia lentiscus L. comme additifs naturels pour la conservation des escalopes de dinde. Dans un premier temps l’activité antimicrobienne des extraits aqueux préparés par macération, infusion, décoction et digestion et de l’huile essentielle obtenue par hydrodistillation de feuilles de Pistacia lentiscus a été étudiée in vitro vis-à-vis de sept souches bactériennes et trois espèces fongiques. Les résultats ont mis en évidence que les extraits aqueux de feuilles sont dotés in vitro d’une activité antibactérienne et antifongique dépendant du protocole d’extraction et de la souche bactérienne. Les extraits infusés et digérés ont montré un pouvoir inhibiteur sur Enterococcus faecalis et Staphylococcus aureus plus important que celui de l’huile essentielle et sont inactifs vis-à-vis d’Escherichiacoli et de Salmonella enteritidis. Ils inhibent également la croissance de Penicillium (-35%) et de Fusarium (-19%). Dans un second temps, une application sur des escalopes de dinde fraiches, de broyat de feuilles sèches et d’extrait aqueux infusé a montré une inhibition de la croissance de la flore mésophile aérobie totale et la flore fongique pendant un stockage de huit jours à +4°C. En conclusion, les extraits foliaires de Pistacia lentiscus L. peuvent être utilisés pour réduire la charge microbienne pendant le stockage d’une semaine des escalopes de dinde fraîches.

 

Mots clés: Conservation des aliments, Pistacia lentiscus L., extraits de plantes, arbre au mastic, charge microbienne

 

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