Category: Volume 5
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Etude technico-économique de méthodes d’extraction de l’ADN chez le lapin Européen (Oryctolagus cuniculus) à partir du sang

M. BEN LARBI ^1*

G. NAOUARIA¹

M. H. YAHYAOUI ²

B. HADDED ¹

¹ Laboratoire des ressources animales et alimentaire, Institut National Agronomique de Tunisie (INAT), 43 Avenue Charles Nicole, 1082 Tunis, Tunisie

² Institut des Régions Arides Médenine (IRA) Route du Djorf Km 22.5 Médenine, Tunisie

Abstract - Several DNA isolation techniques have been developed and some ready-to-use kits are now widely commercialized. To test the reliability of these products, two standard methods and two kit-extractions have been performed on a total number of ten rabbit blood samples.

The DNA obtained revealed significant difference between the methods in concentration, but not in terms of DNA purity. The highest DNA quantity was obtained by the method saline (305μg) and the lowest with the kit Invitrogen ® (7.33μg). The quality of the DNA, characterized by the A260/A280 ratio of 1.8 is good for all samples, except for extractions with saline extraction method, which gives a lower value (1.57) than all the others.

A comparative study concerning the extraction costs reveals that the used kits are up to 5 times more expensive than the standard methods.

Other parameters such as extraction time, the initial volume of blood required may explain the use of a method or the other. These are the specific needs of the experimenter who decide on the method of DNA isolation used.

Key words: DNA extraction / rabbit / standard methods / kit.

Résumé - Diverses techniques d’isolement d’ADN ont été élaborées. Outre les méthodes classiques, des méthodes d’extraction commercialisées sous forme de kits prêts à l’emploi ont surgit récemment. L’étude de la fiabilité de ces kits a été l’objectif de ce projet. Deux méthodes d’extractions classiques et deux kits d’extractions ont été utilisés sur une dizaine d’échantillons de sang de lapin.

L’ADN obtenu a révélé des différences significatives entre les méthodes utilisées en termes de concentration, mais pas en termes de pureté de l’ADN. La quantité la plus élevée était obtenue par la méthode saline (305µg) et la plus faible avec les kits commercialisés, en particulier avec l’extraction avec le kit Invitrogen® (7.33µg). La qualité de l’ADN, caractérisée par un rapport A260/A280 de l’ordre de 1,8, est bonne pour tous les échantillons, sauf pour les extractions avec la méthode d’extraction saline, qui donne des valeurs significativement plus faibles (1.57) que tous les autres.

Par contre, au niveau des coûts, les kits utilisés coûtent 2.5 voire 5 fois plus cher que les méthodes classiques.

D’autres paramètres comme la durée de l’extraction, le volume initial de sang requis peuvent expliquer le recours à l’utilisation d’un procédé ou l’autre. Ce sont les besoins spécifiques de l’expérimentateur qui décident de la méthode d’isolement d’ADN utilisée.

Mots clé : extractions, ADN, lapin, méthodes classiques, kits

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Evaluation Agro-morphologique de Quelques Génotypes Locaux de Pois Chiche d’Hiver (Cicer arietinum L.) en Tunisie

K. Khamassi ^*

R. Chaabane

S. khoufi

M. Kharrat

M. Ben Naceur

Université de Carthage, Institut National de la Recherche Agronomique de Tunisie, Rue HédiKarray, 2049 Ariana, Tunisia.

Abstract - Thirteen kabuli chickpea genotypes including some varieties released in Tunisia have been characterized for different agro-morphological traits in order to estimate variability levels between them. For this purpose a trial was conducted at Ariana in Tunisia. Univariate analysis showed high significant differences between genotypes for many traits. Principal Component Analysis was performed for all traits and allowed to define three axes that explain 68.4% of the total traits variability. The first group is formed by genotypes ‘Bochra’, ‘Chetoui' and’ ‘line 5’. The second clustered genotypes ‘Kasseb’, ‘Neyer’, ‘Beja 1’and' Lineage 4. Genotypes ‘Line 3’ and ‘Line 6’ represent the third group, while the fourth group is formed by genotypes ‘Lineage 1’, ‘Lineage 2’,‘Amdoun 1’ and ‘Beja 2’. Genotypes could be classified in four groups by reference to the chosen axes.. Genotypes forming the same group are closely related to each other according to their common morphological characters (the number of pod to 1 only seed, the number of days to maturity, the output in seeds by plant and with the size of pods…)

Keywords : Chickpea / morphological diversity / PCA.

Résumé - Dans le but d'estimer le degré de variabilité de 13 génotypes de pois chiche de type Kabuli comportant des variétés inscrites dans le catalogue tunisien, un essai visant la caractérisation agro-morphologique de ces génotypes a été conduit à l'Ariana / Tunisie. L'analyse uni-variée des paramètres étudiés a fait apparaitre des différences significatives pour la majorité des caractères. L'analyse en composantes principales a permis de définir trois axes qui expliquent 68,4% de la variabilité totale des paramètres. Les résultats obtenus ont permis de séparer les génotypes en quatre groupes différents selon les axes choisis. Le premier groupe est formé par les génotypes ‘Bochra’, ‘Chetoui’ et ‘Lignée 5. Le deuxième clustérise les génotypes ‘Kasseb’, ‘Neyer’, ‘Béja 1’ et ‘Lignée 4’. Les génotypes ‘Lignée 3’ et ‘Lignée 6’forment le troisième groupe, alors que, le quatrième groupe est formé par les génotypes ‘Lignée 1’, ‘Lignée 2’, ‘Amdoun 1’ et ‘Béja 2’. Cette séparation est basée essentiellement sur le nombre de gousses mono graine, le nombre de jours nécessaires pour atteindre 50% de floraison, le nombre de jours nécessaires pour atteindre la maturité, le rendement en graines par plante et le poids de cent graines …).

Mots-clés : Pois chiche / diversité morphologique / Analyse en composantes principales.

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Effect of fenugreek seeds on hens’ egg yolk color and sensory quality

H. Abdouli ^*

S. Belhouane

E. Hcini

Laboratory of Improvement and Integrated Development of Animal Productivity and Food Resources, Higher School of Agriculture of Mateur, University of Carthage, Tunisia

Abstract - A study was conducted to evaluate the effects of ground fenugreek seed given to laying hens at 0 (FS0), 2 (FS2), 4(FS4) or 6(FS6) g/hen/d on egg color and sensory quality. Forty, 52-wk-old, Lohmann White laying hens (10 hens per treatment) were fed for 45 days 100 g/d of a basal diet containing in addition the specified ground fenugreek seed amounts. There were no differences (P>0.05) in egg yolk color scores (RYCF), nor in yellowness (b*) whereas lightness (L*) was increased (P<0.05) and redness (a*) was reduced (P<0.05) by both FS4 and FS6 diets. Egg yolk off-flavor and over all acceptability scores were not affected (P>0.05) by ground fenugreek seed. Off-flavor scores varied from ‘very weak’ to ‘weak’ and acceptability appreciation ranged from ‘not like or dislike’ to ‘like slightly’. It can be concluded that ground fenugreek seeds given to Lohmann Whilte laying hens at up to 2 g/hen/d had no effect on egg color and sensory quality. More than 2 g fenugreek seed/d had an adverse effect on egg yolk redness.

Key words: Fenugreek seed / yolk color / sensory quality.

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Effet de la température sur la germination, la dégradation des réserves protéiques et minérales des graines du gombo (Abelmoschus esculentus L.)

B. Ben Dkhil ^*

M. Denden

Laboratoire d’Agronomie, Institut Supérieur Agronomique de Chott-Mariém 4042 Sousse.

Abstract - In order to study the physiological and biochemical responses of okra seed germination (Abelmoschus esculentus) during time under three temperature regimes (10, 25 and 40°C), an experiment was carried out on laboratory in a dark condition. Temperature effects on germination are studied in relation with water absorption, the degradation and mobilization of stored proteins and mineral reserves. Results indicated that 25°C was the optimal temperature that favorises a good aptitude to germinate, whereas low (10°C) and high temperatures (40°C) inhibited germination. Low temperature (10°C) slowed the rate of imbibition, increased proteins content and protease activity. Thermal inhibition of germination at 40°C is the consequence of a decrease on protease activity and toxicity due to sodium accumulation.

Key words: germination / temperature / Abelmoschus esculentus / stored proteins / protease / minerals reserves

Résumé - L’effet de la température sur la germination des graines du gombo (Abelmoschus esculentus L.) est étudié en relation avec la quantité d’eau absorbée, la mobilisation et la dégradation des réserves protéiques et l’utilisation des éléments potassium, sodium et calcium. Les résultats obtenus ont montré que le gombo est sensible à une variation de température, la germination est optimale à 25°C et elle est totalement inhibée à 10 et 40°C. Une basse température de 10°C a stimulé une augmentation de la teneur en protéines et de l’activité protéasique au niveau de l’embryon. L’inhibition de la germination à 40°C est la conséquence d’une inhibition de l’activité protéasique au niveau des cotylédons et d’une toxicité de l’embryon par l’élément sodium.

Mots clés : germination / température / Abelmoschus esculentus / réserves protéiques / protéases / réserves minérales

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