Diversité Génétique de la population des Poneys des Mogods du Nord Ouest de la Tunisie.

M. Mezir Haddad ¹

B. Jemmali ²

A. Bedhiaf ³

S. Bedhiaf ⁴

M. Djemali ³

¹  Fondation Nationale d’Amélioration de la Race Chevaline, Tunisie

²  Laboratoire ADIPARA, Département des Sciences et des Techniques de la Production Animale, Ecole Supérieure d’Agriculture de Mateur, Université de Carthage, Tunisie

³  Institut National Agronomique de Tunis

⁴  Institut National de la Recherche Agronomique de Tunisie

Summary - The aim of this study was to estimate the genetic diversity among Mogod’s pony of Tunisia. Ten selected microsatellites markers were used for a sample of 63 Mogod’s pony genotypes. The number of alleles per locus varied from 2 to 6 with an average of 4.231 alleles per locus. For the whole population, the average of alleles per locus was 3,385. The mean of the observed heterozygosity (Ho) was 0.004. This value was lower than expected with heterozygosity (He) value 0,508. The average inbreeding coefficient was 99.26% in Mogod’s pony population. Results of this study showed that Mogod’s pony population has two different ecotypes and indicated that the population has a low genetic variability and very high inbreeding coefficient. An urgent design of conservation scheme is highly recommended.

Keys words : Mogod’s, genetic, microsatellites, Tunisia.

Résumé : L’évaluation de la diversité génétique au sein de la population poney des Mogods de Bazina et de Nefza. Dix microsatellites pour un total de 63 individus a été utilisés. Le nombre d’allèles par locus a varié de 2 à 6, avec une moyenne de 4,231 allèles par locus. La moyenne d’allèles par locus était de 3,385. Le taux de l’hétérozygotie observée était de 0,004. Ces valeurs sont inférieures à celles de l’hétérozygotie attendue : 0,508. Le coefficient de consanguinité était élevé de 99,26 %. Les résultats de ce travail ont identifié l’existence de deux écotypes différenciés génétiquement entre la région de Bazina et de Nefza. La nécessité de mettre en place un schéma de conservation in situ et ex situ de cette population est recommandée.

Mots-clés : Mogods, génétique, microsatellites, Tunisie.

4. Nombre d’allèles efficients pour un locus :

La moyenne du nombre d’allèles efficients pour les 63 échantillons d’ADN de poneys des Mogods était de 3,155 ± 0,658. La moyenne des nombre d’allèles efficients pour les poneys des Mogods issus de Nefza était de 1,325 ± 0,301 et celle de Bazina était de 2,993 ± 0,560 (Tableau 2).

5. Indice de Fixation de Wright :

On note que l’indice de fixation était égale à 1 pour les loci HTG004, LEX073, SGCV28, ASB002 et était de - 0,143 pour le locus COR018 et ceci pour la population poney des Mogods issus de Nez est la valeur moyenne de l’indice était de 0,771 ± 0,142. Pour ce qui est de la population de Bazina, la valeur de l’indice de fixation était égale à 1 pour les loci ASB017, HMS002, HTG004, LEX073, SGCV28, UCDEQ425, HTG010, AHT005, ASB002, et COR018. La valeur de l’indice de fixation était égale à 0,989 ± 0,010 pour la population globale de poneys des Mogods ce qui représente le cas d’autofécondation entre les individus (Tableau 3).

6. Coefficient de consanguinité :

Le coefficient de consanguinité pour la population poney des Mogods analysée était de 0,9926 ce qui est relativement très élevée. Le coefficient de consanguinité de la population poney des Mogods de Nefza analysée était de 0,9086. Pour ce qui est de la population poney des Mogods issue de Bazina analysée, le coefficient de consanguinité était égal à 1. D’où une grande consanguinité de cette population poney des Mogods due au choix du même étalon et à un système de reproduction confiné dans le douar.

7. Taux de polymorphisme :

Le nombre de loci polymorphes pour les poneys des Mogods était de 10 loci et le taux de polymorphisme des loci était de 76,92%. En ce qui concerne la population poney des Mogods de Nefza analysée, le nombre de loci polymorphe était de 5 et le taux de polymorphisme des loci était de 38.46 %. Pour ce qui est de la population poney des Mogods de Bazina analysée, le nombre de loci polymorphe était de 10 et le taux de polymorphisme des loci était de 76.92 %.

8. Hétérozygotie observée :

La valeur moyenne de l’hétérozygotie observée chez les 63 échantillons d’ADN de poneys des Mogods analysés était de 0,004 ± 0,004. L’hétérozygotie observée était de 0,019 ± 0,019 pour la population de Nefza et elle était de 0,000 pour la population de Bazina. Le taux d’hétérozygotie observée était de 0,4 %, ce qui est très bas par rapport à celui de Spiti horse qui est de 68,38% (Mamta, 2004) (Tableau 3).

9. Hétérozygotie attendue (Nei) :

La valeur moyenne de l’hétérozygotie attendue selon Nei chez les 63 échantillons d’ADN de poneys des Mogods analysés était de 0,548 ± 0,092. La valeur moyenne de l’hétérozygotie attendue pour les poneys issus de Nefza était de 0,211 ± 0,083 et celui des poneys de Bazina était de 0,550 ± 0,090 (Tableau 3)

10. Hétérozygotie attendue non biaisée (Nei) :

La valeur moyenne de l’hétérozygotie attendue non biaisée chez les 63 échantillons d’ADN de poneys des Mogods analysés était de 0,574 ± 0,097. La valeur moyenne de l’hétérozygotie attendue non biaisée pour les 13 poneys issus de Nefza était de 0,245 ± 0,097 et celui des cinquante poneys de Bazina était de 0,585 ± 0,096 (Tableau 11)

11. Dendrogramme

Les individus poneys des Mogods sont bien individualisés et les unités évolutives se sont regroupées selon les régions de Bazina et Nez ce qui confirme le taux d’homozygotie. On remarque aussi que selon les régions, les unités évolutives hypothétiques sont plus nombreuses ce qui indique une distance génétique plus courte entre les individus.

Même si le coefficient de similarité est de 90% on note une variabilité génétique importante au sein de la population poney des Mogods.

La séparation géographique de la population poney des Mogods issue de la région de Bazina et celle de Nefza a présentée une influence sur l'équipement génétique des individus puisque ceux-ci se sont mis par paquets issus d’une même région (Figure 1). Ce qui a permit l’existence de deux écotypes poneys des Mogods, écotype Bazina et écotype Nefza.

12. Discussion

Les microsatellites utilisés pour la caractérisation moléculaire des poneys des Mogods sont très polymorphes en engendrant 10 loci polymorphes, un taux de polymorphisme de 76,92% et une individualisation des individus au sein du dendrogramme de la détermination du coefficient de similarité. Mais cette population subit une dérive et une érosion génétique puisque son coefficient de similarité est de l'ordre de 90%. Les échantillons des chevaux prélevés sont regroupés selon les régions dont sont originaires les poneys prélevés comme Bazina et Nefza. La caractérisation phénotypique et l'identification des caractères morphologiques des poneys des Mogods avant les prélèvements de sang n’ont pas pu déceler la présence de deux écotypes de Bazina et de Nefza. Par contre, l’analyse moléculaire et génétique a montré l’existence de deux écotypes différents et qui sont l'écotype Bazina et l'écotype Nefza

La moyenne du nombre d’allèles observés par locus de 4,231 ± 0,752 et le faible nombre moyen d’allèles efficients pour un locus de 3,155 ± 0,658. Le nombre d’allèles dans une population dépend de la taille de l’échantillon puisque la découverte d’un nouvel allèle se fait pour chaque nouvel individu observé (Foulley et Olliver, 2006). La moyenne du nobre d’allèles observée varie de 1,462 ± 0,332 pour la population poney des Mogods de Nefza à 3,846 ± 0,649 pour le population poney de Bazina. La moyenne du nombre d’allèle observé par locus est inférieure à celle observée pour les poneys de la mer caspienne (8,69), en sachant que ces derniers sont proches du poney des Mogods et ont même origine (Shahsavarani, 2010) et que ceux des chevaux asiatiques (6,58) et d’Amérique du Sud (5,67) (Luis et al., 2007).

La population poney des Mogods analysée n’est pas à l’équilibre de Hardy-Weinberg puisque tous les microsatellites présentent un écart par rapport é cet équilibre. De plus cette population présente un taux de consanguinité de 90,86%. Ceci est due au mode de l’élevage confinée aux douars de ces poneys et l’utilisation d’un seul étalon.

Les taux d’hétérozygotie observé et attendue sont calculés sous l’hypothèse que la population est à l’équilibre de Hardy Weinberg. L’importance du polymorphisme génétique de la population de 63 individus poney des Mogods s’estime par la comparaison des deux hétérozygoties. L’hétérozygotie attendue de Nei (0,548 ± 0,092) est très supérieure à l’hétérozygotie observée (0,004 ± 0,004) ce qui traduit un déficit en hétérozygotie dans la population. Ceci est dû à une faible variabilité génétique de la population de Nefza et de Bazina créer par le mode d’utilisation des étalons et le mode de la reproduction, puisque généralement, un seul éleveur de la région possède un étalon qui sera utilisé pour la saillie durant plusieurs années et avec les mêmes juments de la région et peut même être apparenté aux juments. La valeur de l’hétérozygotie attendu et non biaisée est de 0,574 ± 0,097.

La valeur de l’hétérozygotie attendue de Nei (0,548) est inférieure à celle du poney Shetland (0,64) (Cunningham 2001), et du cheval indien de race Spiti (0,62) (Mamta Chauchan, 2004) et est proche du poney autochtone de Sicile (0,80) (Marletta et al, 2006)

En ce qui concerne l’Indice de fixation, celui-ci confirme le taux de consanguinité élevé de la population de poney des Mogods puisque sa valeur indique le cas d’autofécondation entre les individus.

De plus, en 1995, une pratique dévastatrice a été stoppée. Cette pratique se résume à l'envoie au Nord Ouest d'étalon de race barbe, d'arabe-barbe, de poney des Mogods, de breton, de breton-barbe et d'Haflinguer. Ces étalons sont stationnés au Nord Ouest dans les stations de l'Office de Développement Sylvo-Pastoral du Nord Ouest pour saillir les juments poneys des Mogods. Ces envoies avaient pour but d’agrandir la hauteur au garrot des chevaux existant dans cette région. Car ces chevaux étaient considérés comme étant porteurs d’une maladie de nanisme. Et c'est pour cette raison que nous trouvons une certaine parenté entre les chevaux barbe et arabe-barbe et les poneys des Mogods. Mais les différents individus sont bien individualisés et bien groupés selon les régions de provenance. Ce qui a encore augmenté l’hétérogénéité et la diversité spécifique de cette population poney des Mogods.

4. Conclusion

Cette caractérisation moléculaire de la population poney des Mogods a permit une évaluation génétique et à fait ressortir la subdivision de cette population en deux écotypes l’écotype Bazina et l’écotype Nefza. De plus, cette analyse a fait ressortir aussi une consanguinité importante qui est due au mode de gestion d’élevage pratiqué dans ces régions montagneuses du Nord Ouest. Les résultats obtenus reflètent le besoin urgent d’une gestion génétique efficace et adéquate pour cette population à effectif limité afin de la préserver et la conserver.

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